Theo báo cáo của Tổng cục Thủy sản, 5 tháng đầu năm 2016, tổng sản lượng thủy sản ước đạt 2,45 triệu tấn, tăng 1,9%, trong đó nuôi trồng đạt 1,15 triệu tấn, tăng nhẹ 0,5% và sản lượng khai thác đạt 1,3 triệu tấn, tăng 3,1% so với cùng kỳ năm trước.
Trong tháng 5, thời tiết thuận lợi cho các hoạt động khai thác thủy sản, nhiều sản phẩm khai thác được có giá trị kinh tế cao như mực, cá thu, cá ngừ sọc dưa,…. tạo điều kiện cho bà con ngư dân bám biển sản xuất. Sản lượng khai thác tăng nhẹ so với cùng kỳ. Tuy nhiên, sự cố môi trường gây ra hiện tượng nhiều loài hải sản chết bất thường tại 4 tỉnh miền Trung từ đầu tháng 4/2016 đã ảnh hưởng đến kết quả hoạt động khai thác và nuôi trồng thủy sản và đời sống của cộng đồng ngư dân 4 tỉnh Hà Tĩnh, Quảng Bình, Quảng Trị và Thừa Thiên Huế. Sản phẩm khai thác không tiêu thụ được khiến nhiều ngư dân phải dừng đánh bắt cá ở ven bờ và vùng lộng. Sản lượng khai thác và giá bán tại một số tỉnh Bắc Trung bộ giảm so với cùng kỳ năm ngoái. Tuy nhiên, trong tháng 5, các địa phương đã nỗ lực triển khai quyết định của Thủ tướng Chính phủ, hỗ trợ khẩn cấp cho người dân bị ảnh hưởng do hiện tượng hải sản chết bất thường. Các cơ quan chức năng đã tổ chức xác nhận hải sản an toàn cho các tàu cá và mở nhiều điểm bán cá sạch cho người dân nên tại một số địa bàn, ngư dân đã yên tâm hơn khi tiếp tục ra khơi khai thác hải sản ở vùng nước ngoài 20 hải lý. Đây cũng là tín hiệu tích cực sau thời gian tàu thuyền của ngư dân phải chịu cảnh nằm bờ do ảnh hưởng từ hiện tượng cá biển chết bất thường.
Trong tháng 5/2016, giá dầu diezen tăng thêm 280đ/lít (ngày 20/5/2016), từ 11.020 – 11/240 đ/lít tăng lên 11.200 đ/lít (vùng 1) và 11.520 đ/lít (vùng 2). Do giá dầu tăng nhẹ, nên chưa ảnh hưởng nhiều đến chi phí đầu vào trong khai thác hải sản. Giá một số loài cá nổi như cá thu, cá nục đều giữ mức giá ổn định, riêng giá cá ngừ đại dương giảm do sản lượng tăng.
Sản lượng khai thác thủy sản trong tháng 5 năm 2016 ước đạt 248,5 nghìn tấn, tăng 1,6% so với cùng kỳ năm 2015. Trong đó, khai thác biển đạt 233,6 nghìn tấn, tăng 1,7%, khai thác nội địa đạt 14,9 nghìn tấn, bằng 99,2% so với cùng kỳ. Lũy kế 5 tháng đầu năm 2016, sản lượng khai thác thủy sản đạt 1.303,4 nghìn tấn, tăng 3,1% so với cùng kỳ năm 2015. Trong đó sản lượng khai thác hải sản ước đạt 1.240,2 nghìn tấn, tăng 3,3% so với cùng kỳ. Sản lượng khai thác cá ngừ đại dương 5 tháng đầu năm 2016 tăng 7,1% so với cùng kỳ, ước đạt 9.605 tấn.
Về nuôi trồng thủy sản, tại đồng bằng sông Cửu Long, tình hình khô hạn, xâm nhập mặn tiếp tục gây ảnh hưởng trực tiếp tới hoạt động nuôi trồng thủy sản ở một số tỉnh ven biển của khu vực. Tình hình thời tiết bất lợi đã ảnh hưởng rất lớn đến sản xuất tôm, diện tích tôm bị thiệt hại khá lớn, chủ yếu là mô hình lúa – tôm và tôm quảng canh khiến cho sản lượng thu hoạch tôm giảm so với cùng kỳ năm trước. Các tỉnh Cà Mau, Kiên Giang và Bạc Liêu bị thiệt hại nghiêm trọng. Theo thống kê ban đầu, diện tích tôm bị thiệt hại của 8 tỉnh ven biển đồng băng sông Cửu Long trên 80.000ha. Giá thu mua cá tra nguyên liệu vẫn có xu hướng tăng, người nuôi có lãi. Tuy nhiên ngành cá tra đang phải đối mặt với sự thiếu hụt nghiêm trọng về nguồn nguyên liệu.